１時間当たりの基礎賃金まで算定できれば，深夜手当の計算はあと一歩です。ここでは，最終的な深夜手当の算出の仕方について考えます。
深夜手当を算出する
所定賃金から除外賃金を除外し，所定労働時間を算出し，１時間当たりの基礎賃金額を算出したら，深夜手当の算定まではあと少しです。
まず，１時間当たりの基礎賃金に実際の深夜労働時間を掛けます。そして，その算出した金額に，深夜手当の割増率を掛けます。深夜手当の割増率は，２５パーセント増以上です。
【 １時間当たり基礎賃金 × 時間外労働時間 × １．２５ ＝ 深夜手当の金額 】
ということになります。
分単位の深夜手当
上記の計算式は１時間当たりの基礎賃金をもとにしていますので，例えば，深夜労働時間が２時間７分だった場合にはどうすればいいのでしょうか？
この場合は，分単位の基礎賃金を算定する必要があります。と言っても難しいことはありません。１時間当たりの基礎賃金を６０で割ればよいだけです。そして，この分単位の基礎賃金に，実際の深夜労働時間を掛け，１．２５倍すればよいということになります。
なお，分単位の労働時間が分かる場合には，必ず分単位での深夜手当も請求すべきです。
深夜手当の割増率
上記のとおり，深夜手当の割増率は，労働基準法によると最低１．２５倍とされています。したがって，就業規則や労働契約などにおいて深夜手当の割増率について定めがなければ，この１．２５倍が適用されることになります。
もっとも，就業規則や労働契約などで深夜手当の割増率を１．２５倍以上とすることも当然可能です。そのような定めがある場合は，その割増率で計算すればよいということになります。
他方，就業規則などで深夜手当の割増率を１．２５倍未満とした場合はどうなるかというと，労働基準法は最低限度の基準ですから，１．２５倍未満と定めたとしてもそのような定めは無効です。したがって，無効な割増率は無視して，１．２５倍で計算すればよいだけです。
